TS. Phạm Quang Huy – PGĐ Học viện, thường trực cơ sở tại Tp. Hồ Chí Minh (từ 3/2004 – 3/2015)
PGS.TS. Lê Thị Vân Hạnh – PGĐ Học viện Hành chính Quốc gia, phụ trách cơ sở tại Tp. Hồ Chí Minh (từ 3/2015 – 7/2017)
TS. Hà Quang Thanh – PGĐ thường trực Phân viện Học viện Hành chính Quốc gia tại Tp. Hồ Chí Minh (từ 5/2018 – nay)
PGS.TS. Huỳnh Văn Thới – PGĐ Phân viện Học viện Hành chính Quốc gia tại Tp. Hồ Chí Minh (từ 6/2018 – nay)